PGS.TS. Phạm Quốc Trung hiện là Trưởng Bộ môn Hệ thống Thông tin Quản lý, Khoa Quản lý Công nghiệp, Trường Đại học Bách khoa – ĐHQG-HCM. Ông cũng đã đảm nhiệm chức vụ Phó Trưởng Khoa (2013-2018), Khoa Quản lý Công nghiệp, Trường Đại Học Bách Khoa Tp.HCM, Việt Nam. Ông là giảng viên ở Bộ môn Hệ thống Thông tin Quản lý của Đại Học Bách Khoa Tp.HCM từ tháng 4/2005. Từ năm 2001-nay, ông cũng giảng dạy thỉnh giảng ở một vài trường Đại học khác, như là: Đại học Huflit, Đại học Quốc gia Tp.HCM, Đại học Hoa Sen, Đại học Kinh tế TP.HCM, Đại học Tôn Đức Thắng, Đại học Việt Đức… Chủ đề nghiên cứu chính của ông bao gồm : hệ thống tìm kiếm thông tin, hệ thống thông tin quản lý, hệ hỗ trợ ra quyết định, hệ quản lý tri thức, thương mại điện tử, học tập điện tử, và đổi mới sáng tạo… Ông đã xuất bản và giảng dạy về các chủ đề trong lĩnh vực Công nghệ Thông tin, Hệ thống Thông tin trong Kinh doanh & Quản lý, Quản lý Tri thức, và Khoa học Dữ liệu.